Клуб основан в 2006 году. Во второй лиге чемпионата Украины провел два чемпионата. В первом дивизионе играет второй сезон.
Клубные цвета красно-белые. Домашние встречи проводит на стадионе «Трудовые резервы» (10 000 мест).
В сезоне 2008/2009 клуб из Белой Церкви стал вторым в группе «А» второй лиги. Повышение в классе серебро не давало. Команда уже готовилась штурмовать эту вершину в следующем чемпионате. Но вмешался случай. С соревнований первой лиги снялся симферопольский «ИгроСервис». Место крымчан в дивизионе решили разыграть между вторыми командами групп второй лиги. «Арсеналу» предстояло сразиться за путевку в компанию выше рангом с ФК «Полтава».
Матч прошел на стадионе «Центральный» в Черкассах 12 июля 2009 года. На нейтральном поле «канониры» оказались сильнее. Победу и выход в первую лигу им принес точный удар Константина Деревлева на 60-й минуте той встречи. Дебютный сезон в первой лиге «Арсенал» провел достойно. По его итогам «канониры» заняли 9-е место. 12 матчей белоцерковцы выиграли, столько же проиграли. Еще десять сыграли вничью.
В центре турнирной таблицы «Арсенал» и в этом сезоне. Весной команда среди лидеров по очкам, набранным во второй части сезона. В апреле команда из Белой Церкви выиграла пять матчей подряд.